作为我国柑桔重要的科学研究中心，中柑所担负着组织协调全国性重大科研或科技项目协作的任务。

从1962年8月组织召开我国柑桔科技界的第一次柑桔科技工作宏观发展论坛“十年柑桔科学规划座谈会”开始，我所主持召开多次全国柑桔科学研究规划会、研讨会、协作会，组织开展了若干全国性科研或科技项目协作工作。如1968年开始的全国柑桔罐藏品种研究协作，1969年开始的全国柑桔良种区划、生态区划和生产区划协作，1974年开始的全国柑桔资源协作和柑桔黄龙病防治研究协作，一直到“七五”、“八五”、“九五”期间农业部科技攻关项目专题主持。又如《中国果树志·柑桔卷》的编纂，在柑桔资源调查、整理的基础上，在全国柑桔科技工作者的关心和通力协作下，以我所为主持单位，由重庆、福建、广东、广西、湖北、湖南、江苏、江西、四川、浙江等柑桔产地59位柑桔科技工作者执笔，历经20多年完成了编写工作。该书共80万字，收集柑桔品种（系）533个，彩图317幅，是一部全面反映我国柑桔资源面貌和相关科研成果的专著，已于2010年1月出版。

50年来，我所还积极为国家及柑桔产区各级政府宏观决策服务，主持或参与全国和地方柑桔产业发展规划编制、项目论证等工作。从20世纪八九十年代长江三峡地区柑桔业规划，到21世纪初在农业部主持下组织编写全国柑桔优势区域发展规划、全国柑桔非疫区建设规划、重庆市柑桔非疫区建设规划等，屡次受到国务院三峡建设委员会、农业部等有关部委的好评。2001年，参加重庆市百万吨优质柑桔深加工产业化项目、四川南部地区40万亩优质甜橙基地建设项目、四川攀枝花西部金沙江河谷富热区10万亩优质甜橙产业化项目等大型项目规划编制。其中，以我所科技人员为主要力量编写的《重庆市百万吨优质柑桔深加工产业化项目规划》，受到重庆市委、市政府的好评。2005年温家宝总理考察了重庆市涪陵区移民柑桔基地，作出了“好好规划，把三峡库区的柑桔产业做成大产业”的指示。为了落实温总理这一指示，我所参与了国家有关部委组织的调研工作，参与撰写了国家支持三峡库区柑桔产业的思路和政策建议，参与提出的国家财政补贴无病容器苗、启动建设重庆三峡库区柑桔非疫区、支持产业化龙头企业发展和幼龄果园抚育期管理等相关建议得到国家批准。

在国家柑桔基地县规划建设（如上世纪60年代中期开始国家外贸基地县建设，80年代中期长江中上游水果带基地县建设，以及80年代先后开始的国家农业部106个柑桔基地县建设）中，我所均作出了重要贡献。

为适应全国柑桔生产大发展的需求，我所于20世纪80年代初成立了专门负责科技成果推广及咨询服务的业务部门，开展了技术咨询、技术服务、成果转让、人员培训等工作。并且针对柑桔生产中出现的问题，大力加强开发研究，将科研产品及科技开发业务范围逐渐从种苗、鲜果、农药，扩大到系列保花保果剂、促花剂、保鲜剂、果蜡、加工品以及小型机械设备等。据不完全统计，50年来，我所直接为全国科研、教学、生产单位累计提供柑桔嫁接苗（包括容器苗、脱毒苗）2000万株以上，砧木苗200万株以上，良种接穗（包括脱毒接穗）3000万枝以上。1988年以来，我所与100多个单位签订科技咨询、技术服务、技术合作协议和技术转让合同130余份，还与澳门恒河集团、汇源集团、三峡建设集团、赣南果业集团、湖南熙可公司和可口可乐（中国）公司等果业龙头企业进行技术合作，为企业提供技术咨询、人员培训、项目可行性研究、项目初步设计和果园规划等技术服务。

从60年代建所开始，我所一直在进行各种形式的技术培训服务。1979年以来在所内开设为期20天以上脱产学习的专业培训班共100多期，为全国各柑桔产区培养专业技术骨干6000多名。每年帮助地方政府在当地定期或不定期培训技术干部或果农。仅1973年一年，就为各地培训柑桔生产技术骨干近1万人；2008年，为江西、四川、重庆、云南、广西、贵州、湖南、湖北等省（区、市）开展特大雨雪冰冻灾害抗冻救灾、新品种及栽培技术培训40余次，发放技术资料15000份，近14000人次参加培训；2009年，先后为重庆、江西、云南、四川、广西、湖南、贵州、陕西等产区举办无病毒三级繁育体系、标准化果园建设、黄龙病防控等技术培训和讲座28场次，培训人员4000余人次。从20世纪70年代末至2000年前后，我所在各基地县举办柑桔技术培训班近100期，为柑桔产区提供《柑桔技术讲习班教材》13000余册。1992—1997年，由我所组织，与西南农业大学联合举办经农业部批准的果树大专《专业证书班》，分别于1995、1997年毕业两届学员，为南方10多个省（市、区）柑桔产区培养大专层次果树专业人才30余名。

编辑出版、公开发行的两个专业刊物《中国南方果树》和《中国果业信息》订户遍布全国29个省（区、市），受到柑桔产区读者的广泛欢迎，同时，根据全国柑桔生产发展动态，我所还不时有针对性地编印各种专题性资料，供生产及科研参考。

此外，我所先后向四川渠县，贵州晴隆、罗甸、惠水、荔波，重庆开县、忠县、万州等地派出科技人员出任科技副县长、副局长、水果办副主任、科技特派员等职，向部分龙头企业派出技术总监等，配合地方开展科技成果和良种推广、科技攻关、技术培训等，并协助当地抓农业、农村工作。